Funciones: Son funciones de la Secretaría Seccional de salud, además de las contempladas en la ley 715 de 2001:

• Formular planes, programas y proyectos para el desarrollo del sector salud y del Sistema General de Seguridad Social en Salud, en armonía con las disposiciones del orden nacional.
• Adoptar difundir, implantar, ejecutar y evaluar, en el ámbito departamental las normas, políticas, estrategias, planes, programas y proyectos del sector salud y del Sistema General de Seguridad Social en Salud, que formule y expida la Nación o en armonía con estas.
• Prestar asistencia técnica y asesoría a los municipios e instituciones públicas que prestan servicios de salud en su jurisdicción.
• Supervisar y controlar el recaudo y la aplicación de los recursos propios, los cedidos por la Nación y los del Sistema General de Participaciones con destinación específica para salud y administrar los recursos del Fondo Departamental de Salud por delegación.
• Vigilar el cumplimiento de las competencias en materia de inspección, vigilancia y control del Sistema General de Seguridad Social en el Departamento.
• Formular ejecutar y controlar el Plan Acción en Salud, y el Plan de Intervenciones Colectivas.
• Velar por la aplicación de las normas técnicas, científicas, administrativas, financieras que expida el Ministerio de Salud, sin perjuicio de las funciones de inspección y vigilancia atribuidas a las demás autoridades competentes.
• Verificar que las instituciones de salud que funcionan en la jurisdicción Departamental, cumplan con los registros mínimos consagrados en las normas que establecen tanto requisitos generales como específicos por tipo de instituciones e iniciar inmediatamente los procesos administrativos correspondientes a aquellos que no las cumplan.
• Organizar una base de datos que permita contabilizar el número de profesionales (generales y especializados) y no profesionales del sector salud que ejercen en el departamento, expedir registros para el ejercicio profesional, según competencias.
• Vigilar y controlar el cumplimiento de las políticas y normas técnicas, científicas y administrativas que expida el Ministerio de Salud, así como las actividades que desarrollan los municipios del departamento, para garantizar el logro de las metas del sector salud y del Sistema General de Seguridad Social en Salud, sin perjuicio de las funciones de inspección y vigilancia atribuidas a las demás autoridades competentes.
• Adoptar, implementar, administrar y coordinar la operación en el Departamento del Sistema Integral de Información en Salud, así como generar y reportar la información requerida por el sistema.

• Promover la participación social y la promoción del ejercicio pleno de los deberes y derechos de los ciudadanos en materia de salud y seguridad social en salud.
• Financiar los tribunales seccionales de ética médica y odontología y vigilar la correcta utilización de los recursos.
• Promover planes, programas, estrategias y proyectos en salud para su inclusión en los planes y programas nacionales.
• Ejecutar las acciones inherentes a la atención en salud de las personas declaradas por vía judicial como inimputables por trastorno mental o inmadurez psicológica, con los recursos nacionales de destinación especifica que para tal efecto transfiera la nación.
• Gestionar la prestación de los servicios de salud, de manera oportuna, eficiente y con calidad a la población pobre en lo no cubierto con subsidios a la demanda, que resida en el Departamento, mediante instituciones prestadoras de servicios de salud públicas o privadas.
• Financiar con los recursos propios, si lo considera pertinente, con los recursos asignados por concepto de participaciones y demás recursos cedidos, la prestación de los servicios salud a la población pobre en lo no cubierto con subsidios a la demanda y los servicios de salud mental en el Departamento.
• Garantizar la adecuada operación del sistema de referencia y contrarreferencia de pacientes en todos los niveles de atención.
• Organizar, dirigir, coordinar y administrar la red de Instituciones Prestadoras de Servicios de Salud Publicas en el Departamento del Magdalena.
• Concurrir en la financiación de las inversiones necesarias para la organización funcional y administrativa de la red de instituciones prestadoras de servicios de salud a su cargo.
• Efectuar en el Departamento, el registro de los prestadores públicos y privados de servicios de salud, recibir la declaración de requisitos esenciales para la prestación de los servicios y adelantar la vigilancia y el control correspondiente.
• Preparar el Plan Bienal de Inversiones Públicas en Salud, en el cual se incluirán las destinadas a infraestructura, dotación y equipos, de acuerdo con la Política de Prestación de Servicios de Salud.
• Vigilar el cumplimiento de las normas técnicas dictadas por la Nación para la construcción de obras civiles, dotaciones básicas y mantenimiento integral de las instituciones prestadoras de servicios de salud y de los Centro de Bienestar de Ancianos.

• Adoptar, difundir, implantar y ejecutar la política de salud pública formulada por la Nación a todo el Departamento.
• Garantizar la financiación y la prestación de los servicios de laboratorio de salid publica directamente o por contratación.
• Establecer la situación de salud en el departamento y propender por su mejoramiento.
• Formular y ejecutar el Plan de Intervenciones Colectivas departamental. Monitorear y evaluar la ejecución de los planes y acciones en salud pública de los municipios de su jurisdicción.
• Dirigir y controlar dentro del Departamento del Magdalena, el Sistema de Vigilancia en Salud Publica.
• Vigilar y controlar, en coordinación con el Instituto Nacional para la Vigilancia de Medicamentos y Alimentos, Invima y el Fondo Nacional de Estupefacientes, la producción, expendio, comercialización y distribución de medicamentos, incluyendo aquellos que causen dependencia o efectos psicoactivos potencialmente dañinos para la salud y sustancias potencialmente toxicas.
• Ejecutar las acciones de inspección, vigilancia y control de los factores de riesgo del ambiente que afectan la salud humana y el control de vectores y zoonosis de competencia del sector salud, en coordinación de las autoridades ambientales y en los municipios de categorías 4ta, 5ta y 6ta de su jurisdicción.
• Coordinar, supervisar y controlar las acciones de salud pública que realicen en el Departamento del Magdalena, las Entidades Promotoras de Salud, las demás entidades que administran el régimen subsidiado, las entidades transformadas y adaptadas y aquellas que hacen parte de los regímenes especiales, así como las Instituciones Prestadoras de Servicios de Salud e instituciones relacionadas.
• Ejercer en el Departamento del Magdalena, la vigilancia y el control del aseguramiento en el Sistema General de Seguridad Social en Salud y en los regímenes de excepción definidos en la Ley 100 de 1993.
• Realizar las demás funciones que en el marco de su naturaleza le sean asignadas a las Secretaría Seccional por autoridad competente.